Чтобы определить аминокислотный состав фрагмента белковой молекулы, начнем с определения последовательности мРНК, которая будет транскрибирована с данной цепи ДНК. В процессе транскрипции нуклеотиды ДНК комплементарно спариваются с нуклеотидами мРНК. Правила комплементарного спаривания таковы: аденин (А) спаривается с урацилом (У) в РНК, тимин (Т) спаривается с аденином (А), цитозин (Ц) спаривается с гуанином (Г), и гуанин (Г) спаривается с цитозином (Ц).
Дана цепь ДНК:
ГГГ-ААТ-ЦЦГ-ГТТ-ЦЦЦ-ТАА-ЦТГ-ГТГ
Транскрибируем эту последовательность в мРНК:
ЦЦЦ-УУА-ГГЦ-КАА-ГГГ-АУУ-ГАК-КАК
Теперь разделим полученную последовательность мРНК на кодоны (триплеты нуклеотидов):
ЦЦЦ-УУА-ГГЦ-КАА-ГГГ-АУУ-ГАК-КАК
Используем таблицу генетического кода, чтобы определить аминокислоты, кодируемые этими кодонами:
- ЦЦЦ (CCC) кодирует пролин (Pro)
- УУА (UUA) кодирует лейцин (Leu)
- ГГЦ (GGC) кодирует глицин (Gly)
- КАА (CAA) кодирует глутамин (Gln)
- ГГГ (GGG) кодирует глицин (Gly)
- АУУ (AUU) кодирует изолейцин (Ile)
- ГАК (GAC) кодирует аспарагиновую кислоту (Asp)
- КАК (CAC) кодирует гистидин (His)
Таким образом, аминокислотная последовательность фрагмента белковой молекулы будет:
Pro-Leu-Gly-Gln-Gly-Ile-Asp-His
Теперь рассмотрим, что произойдет, если третий нуклеотид заменить на аденин. Исходная последовательность была:
ГГГ-ААТ-ЦЦГ-ГТТ-ЦЦЦ-ТАА-ЦТГ-ГТГ
Заменим третий нуклеотид (Ц) на аденин (А):
ГГА-ААТ-ЦЦГ-ГТТ-ЦЦЦ-ТАА-ЦТГ-ГТГ
Транскрибируем новую последовательность в мРНК:
ЦЦУ-УУА-ГГЦ-КАА-ГГГ-АУУ-ГАК-КАК
Разделим на кодоны:
ЦЦУ-УУА-ГГЦ-КАА-ГГГ-АУУ-ГАК-КАК
Используем таблицу генетического кода для новой последовательности:
- ЦЦУ (CCU) кодирует пролин (Pro)
- УУА (UUA) кодирует лейцин (Leu)
- ГГЦ (GGC) кодирует глицин (Gly)
- КАА (CAA) кодирует глутамин (Gln)
- ГГГ (GGG) кодирует глицин (Gly)
- АУУ (AUU) кодирует изолейцин (Ile)
- ГАК (GAC) кодирует аспарагиновую кислоту (Asp)
- КАК (CAC) кодирует гистидин (His)
Как видно, замена третьего нуклеотида на аденин изменяет только первый кодон (ЦЦЦ на ЦЦУ). Однако оба кодона (ЦЦЦ и ЦЦУ) кодируют одну и ту же аминокислоту — пролин (Pro). Таким образом, несмотря на изменение нуклеотидной последовательности, аминокислотная последовательность фрагмента белка останется прежней:
Pro-Leu-Gly-Gln-Gly-Ile-Asp-His
Этот случай демонстрирует избыточность генетического кода, когда разные кодоны могут кодировать одну и ту же аминокислоту.